Христос Зафирис родился 23 февраля 2003 года в Афинах. В 10 лет он переехал в Норвегию, где прошёл школу академий «Форнебу», «Лиллестрём», «Фелламар» и «Волеренга».

Профессиональный дебют состоялся в 2020 году в составе «Гроруд», где за два сезона он провёл 50 матчей, забил три гола и сделал пять ассистов, быстро проявив свой талант. В августе 2021 года перешёл в «Хёугесунн», где продолжил прогрессировать, сыграв 32 матча, забив пять голов и сделав пять результативных передач.

В январе 2023 года сделал серьёзный шаг в карьере, подписав контракт со «Славией» Прага. За чешский клуб он провёл 105 матчей, забил 13 голов и сделал 12 ассистов, завоевав чемпионство в сезоне 2024-25 и Кубок Чехии в сезоне 2022-23.

На уровне сборных Зафирис выступал за все молодёжные команды Норвегии, а также за юношескую сборную Греции U16. В 2024 году принял окончательное решение представлять национальную сборную Греции и 7 сентября 2024 года дебютировал в официальном матче Лиги наций против Финляндии.